Pendidikan Strata S-2 Manajemen Pertahanan bagian dari Fakultas Manajemen Pertahanan Universitas Pertahanan dibuka sejak tahun 2009 oleh Kemhan dan Kemendiknas. Pendidikan yang bertujuan untuk menghasilkan magister sains pertahanan bagi militer dan sipil yang profesional di bidang manajemen pertahanan, memahami tata kelola dan strategi manajemen pertahanan yang berwawasan nasional dan internasional serta mampu mengaplikasikannya untuk kemakmuran bangsa dan negara. Membentuk karakter semangat bela negara yang menjunjung tinggi etika, moral berlandaskan identitas, nasionalisme dan integritas.
